O Instituto ECOSS e o Museu de História Natural de Mato Grosso realizam regularmente exposições temporárias que ampliam a compreensão do público sobre a história natural, arqueológica e cultural da região. Entre os destaques, figuram exposições como “O Pantanal Através dos Esqueletos” (2021), que explorou a fauna característica do bioma pantaneiro, “Pinturas Rupestres de Chapada dos Guimarães” (2022) e “Cerrado: Luz e Sombra” (2022), que evidenciaram a riqueza ambiental e artística do estado. Em 2023, exposições como “Árvore-ser” e “O Segredo do Homem Velho” proporcionaram experiências imersivas, enquanto “Urban Sketchers Cuiabá: Celebrando os 305 anos da Cidade” (2024) e “35 anos do Parque Nacional de Chapada dos Guimarães” (2024) celebraram patrimônios históricos e naturais locais. As exposições temporárias permitem ao público vivenciar conteúdos inovadores, estimulando a pesquisa, a educação patrimonial e a conscientização ambiental, consolidando o MHNMT como um centro dinâmico de difusão científica e cultural.